2000–2009: เฮลโล! โปรเจกต์

อายะเข้าร่วมออดิชันสำหรับมอร์นิมูซูเมะครั้งที่ 4 ใน ค.ศ. 2000 พร้อมกับเชกิ-ดลเพื่อกลายเป็นส่วนหนึ่งของเฮลโล! โปรเจกต์

ในวันที่ 9 ตุลาคม ค.ศ. 2006 งานคอนเสิร์ตสองแห่งถูกยกเลิก เพราะเธอรู้สึกไม่ค่อยสบาย[1]ต่อมามีข่าวลือที่ไม่ทราบแหล่งที่มาว่าเธอมีความผิดปกติของข้อต่อขากรรไกร (Temporomandibular joint disorder; TMJ)[2] หลังยกเลิกสองคอนเสริตแล้ว ผู้จัดการของมัตสึอูระยืนยันว่าข่าวลือนั้นเป็นความจริง โดยเธอต้องกินยาแก้ปวดเพื่อทำงานต่อ[3][4]

ในวันที่ 8 มีนาคม ค.ศ. 2008 มัตสึอูระได้รับหน้าที่แขกลับในพิธีเปิดการแข่งขันกีฬาโอลิมปิกพิเศษฤดูหนาวครั้งที่ 4 ซึ่งเป็นส่วนหนึ่งของการแข่งขันกีฬาโอลิมปิกพิเศษประจำฤดูหนาวปี 2009 ที่จัดขึ้นในบอยซี รัฐไอดาโฮ[5][6] เธอร้องเพลง "คิซูนะ" เป็นซิงเกิลที่ 20 ที่เผยแพร่ในวันที่ 21 พฤษภาคม ค.ศ. 2008[7]

2008–ปัจจุบัน: จบการศึกษากับการสับเปลี่ยน

มีการประกาศอย่างเป้นทางการในวันที่ 19 ตุลาคม ค.ศ. 2008 ว่ามัตสึอูระจะ จบการศึกษา จากเฮลโล! โปรเจกต์พร้อมกับสมาชิกคนอื่น ๆ[8] ก่อนที่เธอจะจบ มัตสึอูระได้เผยแพร่อัลบั้มที่ห้าของสตูดิโอ โอโมอิอาฟูเรเตะ ในวันที่ 21 มกราคม ค.ศ. 2009[9] และซิงเกิลที่ 21 "ช็อกโกแลตดามาชี" ในวันที่ 11 กุมภาพันธ์[10]